DRYな備忘録

Don't Repeat Yourself.

bioinformatics

さようなら、CWL

このエントリは、 Common Workflow Language (CWL) Advent Calendar 2018 - Qiita の25日目です。 tl;dr 落合、バイオインフォやめるってよ つくったバイオインフォ関連OSSのメンテナンスは続けていくつもりです CWLって何よ 2017年4月にベルリンから逃げ帰…

CWLでHello, World。

CWLって何 的なものについては、このあたりをご参考ください。Web系プログラマ諸兄の99%は縁が無いかと思います。 CWL Start Guide JP · pitagora-galaxy/cwl Wiki · GitHub データ解析が再現するということ、あるいは Common Workflow Language... - こんな…

Webプログラマから見た「CWL」の功績と罪過

このエントリは、CWL Advent Calendar 2017 - Qiitaの25日目です。 背景 誰がエモ芸人や CWL is 何? データ解析が再現するということ、あるいは Common Workflow Language... - こんな時間ですがパスタを茹でます 異なる処理系の間で同一のワークフローの実…

Macにsamtoolsをインストール

ゴール macOS Sierra上でsamtoolsコマンドが使える 参考 samtools を使って bam/sam を操作する | Tips for NGS Data Analysis Samtools ログ % cd % mkdir opt % mkdir opt/src % cd opt/src % wget https://github.com/samtools/htslib/releases/download/…